Gegensätzlicher könnten Pater Flynn und Schwester Aloysius Beauvier gar nicht sein. Während der Pater in seinen Predigten für einen weltoffenen Glauben und gegen Intoleranz kämpft, gibt es für Schwester Beauvier nur die strengen Sitten, die sie als Leiterin der Schule St. Nicholas zu bewahren hat. Der Konflikt zwischen den beiden entzündet sich an Donald Miller, dem ersten afroamerikanischen Schüler an St. Nicholas. Ihm soll sich Pater Flynn sexuell genähert haben. Schwester Aloysius nimmt diesen Vorwurf, der nur auf der Aussage der jungen und naiven Schwester James beruht, zum Anlass, den weltoffenen und modernen Pater bis zum Äußersten zu bekämpfen. Glaubensfrage von Regisseur John Shanley setzt die Auseinandersetzung zwischen Tradition und Moderne, die Mitte der Sechzigerjahre nicht nur zwischen Pater Flynn und Schwester Aloysius tobt, gekonnt in Szene. Das ist auch der Verdienst von Philip Seymour Hoffmann und Meryl Streep, die in den Hauptrollen glänzen.